Klimatske spremembe predstavljajo vse večjo grožnjo ribjim staležem v Sredozemlju. Naraščajoče temperature vode, ki se dvigujejo od leta 1940 zaradi povečanega števila vročih dni, negativno vplivajo na morsko favno in ribiško industrijo. Obstaja zaskrbljenost zaradi vedno večjega števila tujerodnih vrst, ki se pojavljajo v regiji, saj je šest odstotkov ribjih vrst v Sredozemlju že tujerodnih.